太平洋戦争の開戦と同時に台湾南部から長駆フィリピン・ルソン島を攻めた日本海軍第三航空隊は、開戦から３日でフィリピンの航空兵力を撃滅し、その勢いで蘭印をも攻める。アメリカ、イギリス、オランダの戦闘機は、日本海軍の零戦に歯が立たず、撃退される一方だった。しかし、そのなかにひとりだけ、性能の劣るＰ‐40やＰ‐39に乗り、零戦の前に立ちはだかるベテランパイロットがいた……。

　空中戦のシーンが連続する痛快航空戦記アクション、いま、ここに誕生！

　昭和17年７月、１機の零戦がアリューシャン列島の小島で無傷のままアメリカ海軍の手に落ちた。
　アメリカ海軍は零戦をサンディエゴに運び、米陸海軍戦闘機との比較テストを実施。零戦は、その長所・短所を把握され、米陸海軍新型機のために苦境に陥ることになる。
　だが、いま日本海軍に、零戦にかわる新型機はなかった。零戦のあまりの勝ちっぷりに安住したがために、次世代機の開発が遅れてしまったのだ。
「新型戦闘機が欲しい！」と切望する国友中尉たちに、突然、本土への帰国命令がくだった。連れていかれた先は、岐阜県の各務ヶ原。ここに新しい戦闘機が待っていた……。

　陸軍戦闘機「飛燕」を空冷エンジンに換装した海軍二式戦闘機「旋風」は、米軍の「コルセア」「ライトニング」「スピットファイア」などを撃退していくが、米軍はさらなる新型機を送り込んでくる。それは米陸軍が最終兵器として開発した「ムスタング」だった。
　苦境に陥る日本軍に対し、米軍は、さらなる攻勢をかけ、ついに南太平洋で、空母対空母の最終決戦が開始された……！